หลังจากเหตุการณ์ที่ได้เกิดขึ้นในดิจิมอนภาค Last Evolution เวลาหลังจากนั้นก็ผ่านพ้นมาถึง 2 ปี ไดสุเกะและเพื่อน ๆ ของเขาใช้ชีวิตเข้าสู่วัยรุ่นมัธยม วันหนึ่งในขณะที่เด็ก ๆ ทุกคนกำลังทำกิจกรรมของตนเอง ดิจิทามะใหญ่ยักษ์ปรากฎขึ้นมาที่กลางเมืองอย่างไร้สาเหตุ ทำให้เหล่าดิจิมอนและกลุ่มของไดสุเกะได้มีโอกาสกลับมาพบกันอีกครั้งพร้อมกับการเดินทางค้นหาสาเหตุของการปรากฎของดิจิทามะ