แซมนักเรียนมัธยมปลายที่ได้รับภารกิจใหม่จากหุ่นยนต์ที่มีชื่อว่า บับเบิลบีที่ต้องช่วยเหลือ ออโต้บอทในการต่อสู้กับ ดีเซปติค่อนซึ่งกำลังมีแผนที่จะค้นหา Matrix of Leadership เพื่อใช้เป็นกำลังในการสร้างหุ่นยนต์ที่มีความแข็งแกร่งยิ่งขึ้น ในขณะที่ ออโต้บอทกำลังพยายามหา Matrix of Leadership ที่ดีเซปติค่อนกำลังมีแผนที่จะค้นหา Sun Harvest เพื่อนำไปใช้ในการสร้างหุ่นยนต์ที่มีพลังงานอย่างไม่จำกัด